A Universidade CESPU concentra a sua matriz formativa nas Ciências da Saúde, Ciências da Vida e em áreas científicas conexas, disponibilizando atualmente 14 ciclos de estudos conferentes de grau. A estrutura académica engloba seis licenciaturas distintas, abrangendo as áreas de Ciências Biomédicas, Ciências Forenses, Ciências da Nutrição, Psicologia, Saúde Pública e Gestão e Administração em Saúde.
A par desta oferta, a academia leciona três mestrados integrados dedicados às Ciências Farmacêuticas, à Medicina Dentária e à Medicina Veterinária. O currículo escolar completa-se com três mestrados independentes em Psicologia da Saúde e Neuropsicologia, Reabilitação Oral e Ciências Forenses, culminando com dois graus de doutoramento nas especialidades de Ciências Biomédicas e Toxicologia.