O SEPNA, enquanto polícia ambiental, tem como missão vigiar, fiscalizar e investigar infrações à legislação ambiental em todo o território nacional, integrando igualmente fóruns nacionais e internacionais sobre estas temáticas.
A atuação da GNR abrange áreas como o ordenamento do território, a prevenção da poluição, a gestão de resíduos e a proteção florestal. Entre 2022 e 2024, registou-se um aumento significativo no número de autos de contraordenação nestes domínios, evidenciando um reforço da atividade fiscalizadora: